222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2720 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 1083 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1009 aa  2045    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1158 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 978 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.66 
 
 		 968 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 881 aa  278  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 958 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 961 aa  250  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 994 aa  241  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 918 aa  240  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 993 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 922 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1097 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 919 aa  225  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 908 aa  217  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.03 
 
 		 940 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 945 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 918 aa  214  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 942 aa  210  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  25.69 
 
 		 1109 aa  210  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 988 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 988 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 885 aa  205  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 888 aa  205  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 948 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 940 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.42 
 
 		 941 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 944 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 939 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 939 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 951 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 976 aa  194  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.3 
 
 		 970 aa  194  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 967 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 904 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 984 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1010 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 1007 aa  177  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 994 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.48 
 
 		 836 aa  171  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.47 
 
 		 960 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 1017 aa  166  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1008 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 1016 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 984 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  24.1 
 
 		 978 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1013 aa  161  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 961 aa  161  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 957 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 1035 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 958 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 921 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 880 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 912 aa  144  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  36.44 
 
 		 927 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 998 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 870 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 934 aa  141  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 998 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 894 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 998 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 869 aa  138  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 1006 aa  137  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 950 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 964 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 914 aa  134  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 927 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 964 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 936 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 936 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1074 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  36.63 
 
 		 954 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 859 aa  128  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 838 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1013 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 888 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 924 aa  125  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 1012 aa  125  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 875 aa  125  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 872 aa  125  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 880 aa  124  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 892 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 951 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 874 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 943 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 875 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 915 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 944 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 874 aa  122  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 887 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 1048 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 874 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 947 aa  121  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 882 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 887 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 900 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  29.76 
 
 		 1210 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 892 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 990 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>