240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2288 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  47.89 
 
 		 1007 aa  878    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  89.84 
 
 		 836 aa  1566    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  47.4 
 
 		 960 aa  853    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 988 aa  875    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 988 aa  875    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  81.42 
 
 		 942 aa  1605    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  46.12 
 
 		 1016 aa  841    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 940 aa  1912    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  48.53 
 
 		 1010 aa  893    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  92.77 
 
 		 939 aa  1805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  92.66 
 
 		 939 aa  1804    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  83.85 
 
 		 940 aa  1652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  90.76 
 
 		 941 aa  1773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  50.11 
 
 		 976 aa  879    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  37.37 
 
 		 959 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  34.82 
 
 		 908 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  34.92 
 
 		 908 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  34.11 
 
 		 908 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 908 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 906 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 921 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 912 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 885 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  31.85 
 
 		 919 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 908 aa  361  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  30.1 
 
 		 918 aa  361  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 921 aa  343  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 938 aa  342  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 943 aa  337  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 924 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 906 aa  326  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 945 aa  325  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 911 aa  320  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 946 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 967 aa  286  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 904 aa  285  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 894 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 915 aa  281  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 974 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 961 aa  258  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 901 aa  256  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 951 aa  250  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 951 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 951 aa  247  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1013 aa  244  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 918 aa  240  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 948 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 958 aa  234  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.81 
 
 		 970 aa  227  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.67 
 
 		 968 aa  223  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 875 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 963 aa  212  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1011 aa  210  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 882 aa  209  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 845 aa  209  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 900 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 878 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 878 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 878 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 878 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1046 aa  205  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 994 aa  205  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 881 aa  204  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 881 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1009 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 880 aa  201  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 967 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 859 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 931 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 887 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 887 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 918 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 922 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 993 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  25.07 
 
 		 986 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 978 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 994 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 919 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 1097 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 874 aa  187  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 927 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 998 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2159  TonB domain-containing protein  84.85 
 
 		 99 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 957 aa  178  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 1048 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 892 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 958 aa  174  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 971 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 917 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 934 aa  171  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 984 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 875 aa  164  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 943 aa  164  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 936 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 990 aa  163  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 1074 aa  162  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 868 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 868 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>