More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2921 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 859 aa  1755    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  48.12 
 
 		 875 aa  787    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 		 892 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 845 aa  479  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 927 aa  465  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 892 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 875 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 		 878 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 878 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 878 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 878 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.37 
 
 		 869 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 870 aa  436  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 874 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 880 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 874 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 926 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 874 aa  406  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 868 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 888 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 868 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 872 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 902 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 900 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 915 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 882 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 887 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 887 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 889 aa  355  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 964 aa  353  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1047 aa  342  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 951 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 951 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 951 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 964 aa  311  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 880 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 948 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 919 aa  297  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 888 aa  295  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 914 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 934 aa  287  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 921 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 912 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 943 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 885 aa  280  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 904 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 881 aa  263  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 990 aa  263  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 925 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 998 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 908 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 931 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 957 aa  247  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 929 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1074 aa  243  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  28.25 
 
 		 906 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 936 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 936 aa  237  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 922 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 1008 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 601 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 901 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  54.29 
 
 		 271 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 908 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 924 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 908 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 838 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.94 
 
 		 908 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.84 
 
 		 908 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 906 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 944 aa  217  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.21 
 
 		 908 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.28 
 
 		 940 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 945 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 942 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 941 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 921 aa  213  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 945 aa  212  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1035 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 836 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 1036 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 911 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  40.2 
 
 		 894 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 917 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 1007 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  26.33 
 
 		 919 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 943 aa  204  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.96 
 
 		 941 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 939 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  25.11 
 
 		 838 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 939 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 984 aa  201  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 918 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 940 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 946 aa  197  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 936 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 842 aa  195  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  26.46 
 
 		 927 aa  195  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 950 aa  194  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>