More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0292 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 927 aa  1904    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 892 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 859 aa  479  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 875 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 868 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 868 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 875 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 902 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 926 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 889 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 888 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 874 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 874 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 872 aa  386  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 874 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 845 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 870 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 869 aa  365  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 878 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 878 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 878 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 878 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 887 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 887 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 881 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 880 aa  354  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 900 aa  346  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 882 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 892 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 964 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 894 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 951 aa  324  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 951 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 951 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 948 aa  320  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 915 aa  320  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1036 aa  320  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1047 aa  318  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 888 aa  293  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 964 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 919 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 914 aa  284  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 880 aa  279  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 904 aa  275  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 929 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 978 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 921 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 925 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 912 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  26.75 
 
 		 986 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 934 aa  257  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 994 aa  257  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 1035 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 993 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 920 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 994 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 990 aa  248  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 885 aa  247  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 979 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 881 aa  238  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 923 aa  235  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 998 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 922 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  28.26 
 
 		 908 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 987 aa  232  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 984 aa  231  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 924 aa  231  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  28.16 
 
 		 908 aa  231  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 908 aa  230  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  26.23 
 
 		 927 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.86 
 
 		 906 aa  229  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 998 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  27.03 
 
 		 978 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 998 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 998 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 901 aa  227  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1013 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.89 
 
 		 968 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 945 aa  224  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 838 aa  224  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 908 aa  224  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 967 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 950 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 906 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1006 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 921 aa  220  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 853 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 901 aa  209  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 976 aa  209  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 943 aa  208  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 998 aa  207  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 988 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.12 
 
 		 908 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 988 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 945 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 936 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 936 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  36.39 
 
 		 1109 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 944 aa  199  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  38.58 
 
 		 958 aa  198  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>