More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1859 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  57.69 
 
 		 947 aa  1003    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 888 aa  1806    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 894 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 986 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 859 aa  303  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 915 aa  301  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 927 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 961 aa  287  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 951 aa  283  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 951 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 951 aa  281  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 978 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 875 aa  278  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 943 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 948 aa  271  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 934 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 880 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 908 aa  262  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 892 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 885 aa  261  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 918 aa  258  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 868 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 881 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 921 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 919 aa  244  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 912 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 925 aa  240  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 933 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 892 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 918 aa  237  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 924 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 838 aa  228  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 936 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1074 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 904 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 922 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 836 aa  221  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 943 aa  218  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 1009 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 889 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.4 
 
 		 838 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 982 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 982 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.13 
 
 		 908 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1035 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 961 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 901 aa  199  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 906 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 853 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 945 aa  189  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 979 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1006 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 908 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 936 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 936 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 926 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 908 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.22 
 
 		 908 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 990 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.11 
 
 		 908 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 878 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.34 
 
 		 919 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 906 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 921 aa  171  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 914 aa  171  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 943 aa  166  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1097 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 939 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 935 aa  162  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.38 
 
 		 941 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 939 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.43 
 
 		 1109 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 911 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 962 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 875 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 958 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  29.8 
 
 		 927 aa  151  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  39.84 
 
 		 957 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 868 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 920 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 1083 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 964 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 746 aa  141  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 1036 aa  140  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  39.04 
 
 		 1048 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 994 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 923 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 963 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 987 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 945 aa  140  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 874 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 888 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 924 aa  139  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 998 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 845 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 869 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 929 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>