More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1557 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  64.74 
 
 		 746 aa  1005    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 853 aa  1742    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 901 aa  462  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 936 aa  452  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 945 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  34.99 
 
 		 842 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  33.96 
 
 		 838 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 917 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 943 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 944 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 941 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 942 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 836 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 935 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  32.02 
 
 		 972 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 946 aa  320  6e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 919 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 938 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 915 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.39 
 
 		 992 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 961 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 875 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 880 aa  227  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 875 aa  220  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1074 aa  213  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 862 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 927 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 868 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 881 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 889 aa  194  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 972 aa  193  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 958 aa  188  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 888 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 870 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 869 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 950 aa  175  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 906 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 922 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 933 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 988 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 988 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 978 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 931 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 994 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 880 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 920 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 874 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.9 
 
 		 940 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  24.19 
 
 		 970 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 845 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 943 aa  162  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 993 aa  162  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 889 aa  161  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.87 
 
 		 908 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 908 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 1007 aa  160  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.79 
 
 		 908 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 917 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 976 aa  158  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 962 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 936 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 943 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 874 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 945 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 958 aa  145  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.39 
 
 		 919 aa  144  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00303  TonB-dependent outer membrane receptor  59.72 
 
 		 155 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.095316  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 945 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  23.6 
 
 		 897 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 894 aa  141  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  22.76 
 
 		 954 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 1006 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 1097 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1035 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.89 
 
 		 1109 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 859 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  23.4 
 
 		 906 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 1010 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 919 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 948 aa  127  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 984 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 921 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 986 aa  124  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 912 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 943 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 947 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 868 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  29.84 
 
 		 986 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1008 aa  118  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 918 aa  118  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 951 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 967 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.69 
 
 		 908 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 990 aa  114  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 892 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 885 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 951 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 964 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 914 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>