More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2944 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  99.43 
 
 		 878 aa  1792    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 878 aa  1802    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  99.77 
 
 		 878 aa  1798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  99.54 
 
 		 878 aa  1794    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 892 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 845 aa  462  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 859 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 887 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 888 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 869 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 887 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 874 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 875 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 874 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 881 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 874 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 872 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 870 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 900 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 880 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 892 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 882 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 927 aa  356  8.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 894 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 868 aa  353  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 868 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 964 aa  332  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 875 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 964 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 926 aa  317  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 915 aa  295  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 889 aa  294  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 951 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 951 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 951 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 885 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1036 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 958 aa  281  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 948 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 961 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 880 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 918 aa  266  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 919 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 958 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 931 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 993 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 934 aa  243  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 994 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.14 
 
 		 908 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 908 aa  231  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  27.27 
 
 		 927 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 908 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.9 
 
 		 908 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 908 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.69 
 
 		 908 aa  224  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 942 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 938 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 939 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 939 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 933 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 967 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.32 
 
 		 940 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 940 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  52.38 
 
 		 271 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 945 aa  207  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 946 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 945 aa  199  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 936 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 936 aa  197  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 945 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 944 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.17 
 
 		 959 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 917 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 971 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.34 
 
 		 836 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 974 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 1007 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 921 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 944 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1035 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 942 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 888 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 912 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1047 aa  173  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 902 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1013 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 947 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 924 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 967 aa  160  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 1097 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 943 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 920 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.28 
 
 		 1109 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1008 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1011 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.81 
 
 		 978 aa  155  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.62 
 
 		 986 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 998 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>