253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2063 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 945 aa  1934    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  40.62 
 
 		 908 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  41.2 
 
 		 908 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  40.82 
 
 		 908 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 908 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  40.19 
 
 		 908 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 906 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  39.73 
 
 		 918 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  40.26 
 
 		 919 aa  582  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 943 aa  571  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  39.27 
 
 		 921 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 911 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 924 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 906 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 938 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 946 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 967 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 971 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 939 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 939 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 974 aa  335  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 908 aa  334  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  29.53 
 
 		 940 aa  330  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  29.17 
 
 		 941 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 940 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  29.62 
 
 		 942 aa  320  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1007 aa  310  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  28.02 
 
 		 959 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 988 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 976 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 988 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 885 aa  283  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  28.87 
 
 		 836 aa  281  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1010 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 1016 aa  272  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.15 
 
 		 960 aa  266  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 904 aa  265  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 921 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 912 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.31 
 
 		 970 aa  222  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 901 aa  220  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 958 aa  209  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 878 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 892 aa  201  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 878 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 878 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 878 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1013 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 961 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 894 aa  194  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  23.98 
 
 		 986 aa  191  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 1074 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 963 aa  188  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 923 aa  187  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 979 aa  184  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 920 aa  184  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 880 aa  183  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.27 
 
 		 906 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 874 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 892 aa  177  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 998 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 874 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 958 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 870 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 872 aa  170  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 888 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  36.15 
 
 		 312 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 922 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 934 aa  165  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 887 aa  164  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 984 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 1013 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 887 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  29.45 
 
 		 1109 aa  160  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  23.57 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1006 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 987 aa  152  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1097 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 943 aa  149  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 914 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.76 
 
 		 954 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1046 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 994 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 915 aa  140  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  22.61 
 
 		 838 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 967 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1011 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 1011 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 924 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 993 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 990 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  39.51 
 
 		 1034 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 926 aa  127  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 927 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 933 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 918 aa  125  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 948 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  29.41 
 
 		 978 aa  124  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 982 aa  124  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>