265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1661 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  47.05 
 
 		 1007 aa  870    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  83.85 
 
 		 940 aa  1652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  100 
 
 		 940 aa  1914    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  83.63 
 
 		 836 aa  1463    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  50.5 
 
 		 988 aa  867    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  51.92 
 
 		 976 aa  898    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  46.94 
 
 		 960 aa  843    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  83.65 
 
 		 942 aa  1634    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  46.59 
 
 		 1016 aa  833    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  50.5 
 
 		 988 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  49.12 
 
 		 1010 aa  894    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  86.06 
 
 		 939 aa  1680    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  85.96 
 
 		 939 aa  1679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  84.29 
 
 		 941 aa  1648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  38.89 
 
 		 959 aa  599  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  82.83 
 
 		 312 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  33.57 
 
 		 908 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  33.71 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 908 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  33.61 
 
 		 908 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 906 aa  416  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 885 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 921 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 912 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  32.15 
 
 		 919 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  31.26 
 
 		 918 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 908 aa  357  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 943 aa  353  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 921 aa  353  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 938 aa  347  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 924 aa  337  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 911 aa  333  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 945 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 906 aa  324  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 946 aa  320  9e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 904 aa  294  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 915 aa  291  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 967 aa  289  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 971 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 894 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 961 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 901 aa  253  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 918 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1013 aa  245  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 948 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 958 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 951 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 951 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 951 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 875 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  27.51 
 
 		 968 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 882 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 963 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 1011 aa  223  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1046 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 900 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1009 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 878 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 978 aa  215  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 881 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 931 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 922 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 859 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 878 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 878 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  27.04 
 
 		 970 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 878 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 887 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 887 aa  211  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 994 aa  209  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 881 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 964 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 845 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 984 aa  204  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1013 aa  204  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  26.09 
 
 		 986 aa  201  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 1083 aa  200  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 892 aa  200  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 993 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 967 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 918 aa  199  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1048 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 933 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 874 aa  194  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 929 aa  191  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 1097 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 994 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 934 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 919 aa  184  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 998 aa  184  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 925 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 974 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  23.64 
 
 		 906 aa  177  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 917 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 958 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 942 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 957 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 944 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 941 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>