More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2924 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  48.12 
 
 		 859 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 875 aa  1800    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 892 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 927 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 878 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 878 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 878 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 902 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 878 aa  406  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 892 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 845 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 875 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 868 aa  365  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 868 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 869 aa  362  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 874 aa  360  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 881 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 915 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 926 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 870 aa  353  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 872 aa  351  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 880 aa  350  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 888 aa  350  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 887 aa  349  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 887 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 894 aa  344  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 874 aa  343  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 874 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 889 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 900 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 882 aa  326  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1047 aa  320  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 951 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 951 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 951 aa  312  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 1036 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 961 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 964 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 880 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 948 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 964 aa  290  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 918 aa  273  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 914 aa  261  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 920 aa  252  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 885 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 904 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 921 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  27.07 
 
 		 906 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 912 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 925 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 929 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.72 
 
 		 940 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 853 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  26.06 
 
 		 941 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 939 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 922 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 939 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 942 aa  228  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.83 
 
 		 927 aa  227  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 945 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 998 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 998 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 998 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 978 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 940 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 901 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 986 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 921 aa  212  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 901 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 936 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 946 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 601 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 944 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 942 aa  207  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 976 aa  207  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 943 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 938 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 941 aa  207  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 988 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 946 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 944 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 836 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 988 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 1007 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  25.76 
 
 		 836 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 945 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 943 aa  197  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 918 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 917 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 936 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 936 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 1048 aa  193  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 978 aa  193  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  50.24 
 
 		 271 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.91 
 
 		 970 aa  190  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 842 aa  190  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 950 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 943 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>