More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00241 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 885 aa  1808    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  55.03 
 
 		 921 aa  1001    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  54.92 
 
 		 912 aa  1001    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 904 aa  498  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 908 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 901 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  32.92 
 
 		 941 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 939 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 939 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  32.26 
 
 		 940 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 976 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 940 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  32.3 
 
 		 942 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 988 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 988 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1007 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  31.43 
 
 		 960 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  30.34 
 
 		 908 aa  353  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  32.83 
 
 		 836 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 1016 aa  349  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 921 aa  338  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  30.62 
 
 		 908 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 1010 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 908 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  30.48 
 
 		 908 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  28.23 
 
 		 919 aa  325  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 908 aa  318  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.68 
 
 		 918 aa  317  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 906 aa  317  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 915 aa  306  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 906 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 938 aa  297  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 943 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 946 aa  291  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 924 aa  288  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 911 aa  287  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 878 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 945 aa  283  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 878 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 878 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 878 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 859 aa  280  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 894 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  28.29 
 
 		 970 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 934 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 961 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 892 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 951 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 951 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 951 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  26.6 
 
 		 959 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 948 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 967 aa  250  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 888 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 875 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 927 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 974 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 881 aa  226  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 1011 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 845 aa  221  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 963 aa  218  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 868 aa  217  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 971 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 868 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 875 aa  213  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 918 aa  212  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 922 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 918 aa  211  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 929 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 933 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 1009 aa  205  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1013 aa  204  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 925 aa  204  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 889 aa  202  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 931 aa  201  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 869 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 882 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1046 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 993 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 880 aa  197  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 902 aa  197  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 881 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 874 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 900 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 964 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 874 aa  194  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  38.05 
 
 		 312 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 842 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 901 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 958 aa  188  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 874 aa  188  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 919 aa  188  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 892 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 887 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 934 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 887 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 888 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.12 
 
 		 838 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 964 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 943 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>