244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3075 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  60.68 
 
 		 1007 aa  1219    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  49.75 
 
 		 940 aa  889    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  48.73 
 
 		 836 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  61.83 
 
 		 960 aa  1226    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  58.62 
 
 		 1016 aa  1197    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 988 aa  2005    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  51.93 
 
 		 942 aa  877    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  50.25 
 
 		 940 aa  882    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  62.18 
 
 		 1010 aa  1271    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  50.15 
 
 		 939 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  78.9 
 
 		 976 aa  1564    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  50.05 
 
 		 939 aa  889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  99.7 
 
 		 988 aa  2000    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  49.65 
 
 		 941 aa  889    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  37.18 
 
 		 959 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  33.85 
 
 		 908 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  33.37 
 
 		 908 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  33.27 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 906 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 885 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  31.8 
 
 		 918 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  58.38 
 
 		 312 aa  363  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 912 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 921 aa  357  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 908 aa  356  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 943 aa  347  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 911 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  30.32 
 
 		 919 aa  338  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 921 aa  330  8e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 906 aa  313  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 915 aa  310  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 904 aa  307  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 945 aa  296  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 938 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 946 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 924 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  27.74 
 
 		 970 aa  280  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 967 aa  277  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 894 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 971 aa  268  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 901 aa  265  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 951 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 961 aa  258  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 951 aa  258  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 951 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 974 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 948 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 918 aa  242  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 1097 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1011 aa  241  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1013 aa  231  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 963 aa  230  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 958 aa  227  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  27.28 
 
 		 968 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 978 aa  221  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1046 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 922 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 993 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 934 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 919 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 1009 aa  208  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 927 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 967 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 918 aa  205  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 875 aa  204  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 934 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 958 aa  199  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1013 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 994 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 943 aa  192  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 929 aa  191  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 881 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  24.04 
 
 		 1109 aa  190  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 933 aa  189  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.93 
 
 		 927 aa  184  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 957 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 887 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 887 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 914 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 936 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 978 aa  178  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 936 aa  178  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 942 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 943 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 990 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 941 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 998 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 944 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 920 aa  172  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 853 aa  171  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 892 aa  171  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 945 aa  171  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 917 aa  170  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 926 aa  168  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 924 aa  168  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 945 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 882 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>