244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4482 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  634    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 940 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  94.59 
 
 		 939 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  94.59 
 
 		 939 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  94.59 
 
 		 941 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  91.55 
 
 		 836 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  82.83 
 
 		 940 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  79.87 
 
 		 942 aa  484  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  62.99 
 
 		 1010 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  61.61 
 
 		 1016 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  58.38 
 
 		 988 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  60 
 
 		 960 aa  362  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  58.38 
 
 		 988 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  56.83 
 
 		 1007 aa  355  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  62.23 
 
 		 976 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  50 
 
 		 959 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  45.18 
 
 		 908 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  44.85 
 
 		 908 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  44.63 
 
 		 908 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  43.05 
 
 		 908 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  41.55 
 
 		 906 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 908 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  38.8 
 
 		 921 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 912 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 885 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  35.5 
 
 		 918 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 906 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 943 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 938 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 946 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  40.3 
 
 		 908 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  39.1 
 
 		 919 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 911 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 945 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 967 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 974 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  46.56 
 
 		 921 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 971 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 901 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 924 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 904 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 964 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  32.65 
 
 		 970 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1013 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 894 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 963 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 880 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  31.07 
 
 		 1210 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 881 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 900 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 964 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 998 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 845 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 887 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 887 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1008 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 882 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 951 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 961 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 951 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 915 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 951 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 994 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1097 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 948 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 869 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 1240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 1036 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 874 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 888 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 874 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.56 
 
 		 978 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 1047 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 872 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 934 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 870 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 		 878 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 874 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  28.44 
 
 		 906 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1046 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  39.11 
 
 		 878 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  30.77 
 
 		 968 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 998 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  39.11 
 
 		 878 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  39.11 
 
 		 878 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 931 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 922 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 990 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1013 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 929 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 982 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 982 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 958 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  32.74 
 
 		 986 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1074 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 859 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1013 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 998 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>