243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01879 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  62.62 
 
 		 946 aa  1222    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 938 aa  1902    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  41.86 
 
 		 908 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  41.03 
 
 		 908 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  41.33 
 
 		 908 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 967 aa  777    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  43.34 
 
 		 971 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  42.63 
 
 		 974 aa  729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 		 908 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  41.23 
 
 		 906 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  42.07 
 
 		 908 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  37.22 
 
 		 919 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 921 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 		 911 aa  485  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 924 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 906 aa  462  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 945 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  31.4 
 
 		 918 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 943 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  29.93 
 
 		 940 aa  347  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 940 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 939 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 939 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  28.69 
 
 		 941 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 942 aa  330  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 921 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.12 
 
 		 960 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 912 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 885 aa  297  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  28.18 
 
 		 836 aa  294  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 988 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1007 aa  293  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 988 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  28.19 
 
 		 959 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 904 aa  273  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 976 aa  272  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 901 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 943 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1097 aa  239  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 961 aa  237  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 958 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1016 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 998 aa  224  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  26.08 
 
 		 1109 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 878 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 878 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 878 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 878 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 894 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 915 aa  212  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 948 aa  208  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 875 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 998 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 880 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 882 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 998 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 998 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1010 aa  194  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 951 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 920 aa  190  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 951 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 900 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 951 aa  189  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 958 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 881 aa  185  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 994 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 870 aa  181  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 918 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  34.43 
 
 		 312 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 926 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 887 aa  177  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 922 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 994 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 964 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 887 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 964 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 845 aa  173  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 927 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 889 aa  172  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.43 
 
 		 970 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 944 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 892 aa  169  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 1074 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 874 aa  165  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 868 aa  165  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1011 aa  164  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 908 aa  163  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  24.27 
 
 		 954 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 838 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 936 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 936 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 993 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 945 aa  154  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 982 aa  150  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 982 aa  150  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 1048 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 944 aa  147  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>