More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4091 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  44.52 
 
 		 924 aa  736    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  45.15 
 
 		 906 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  44.95 
 
 		 908 aa  717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  45.8 
 
 		 908 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  45 
 
 		 908 aa  720    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  42.21 
 
 		 911 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  50.59 
 
 		 921 aa  862    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 919 aa  1872    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 908 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  46.01 
 
 		 908 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 906 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 945 aa  595  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  38.49 
 
 		 943 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  38.34 
 
 		 946 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 938 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  37.39 
 
 		 918 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 967 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 971 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 974 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  31.68 
 
 		 940 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 939 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 939 aa  386  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  32.05 
 
 		 942 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  32.75 
 
 		 941 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 940 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 908 aa  350  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 1007 aa  339  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 976 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1010 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 988 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 988 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 921 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 912 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 885 aa  327  7e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1016 aa  326  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  31.71 
 
 		 836 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.44 
 
 		 960 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 904 aa  293  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  27.25 
 
 		 959 aa  280  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 901 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 943 aa  236  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 915 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 934 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.16 
 
 		 970 aa  231  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 958 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 868 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 868 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 859 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 951 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 951 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 951 aa  210  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 875 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 963 aa  204  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 948 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 926 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 961 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 967 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 943 aa  195  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1046 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  23.6 
 
 		 986 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 892 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 931 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 919 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 920 aa  190  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 892 aa  190  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 889 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 881 aa  188  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 845 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.92 
 
 		 968 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 923 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 994 aa  180  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 998 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 998 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 944 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 998 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 998 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 998 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  39.1 
 
 		 312 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.51 
 
 		 838 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 1048 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 1074 aa  171  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 836 aa  171  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 874 aa  170  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 917 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 918 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 1006 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 961 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1008 aa  168  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 984 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1013 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 934 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 888 aa  164  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  33.08 
 
 		 1109 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 838 aa  159  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 986 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 914 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 944 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 945 aa  155  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 1097 aa  151  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 990 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>