More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1410 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  99.77 
 
 		 878 aa  1798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  99.54 
 
 		 878 aa  1794    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  99.32 
 
 		 878 aa  1791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 878 aa  1802    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  37.83 
 
 		 892 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 845 aa  459  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 859 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 887 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 869 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 888 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 874 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 887 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 875 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 874 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 872 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 874 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 870 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 880 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 900 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 892 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 882 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 927 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 894 aa  353  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 868 aa  350  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 868 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 964 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 875 aa  324  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 964 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 926 aa  316  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 915 aa  296  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 889 aa  293  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 951 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 951 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 951 aa  288  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1036 aa  282  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 958 aa  281  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 885 aa  281  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 948 aa  276  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 601 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 961 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 880 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 918 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 919 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 931 aa  255  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 958 aa  254  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 993 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 934 aa  241  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 994 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.23 
 
 		 908 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 908 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  27.27 
 
 		 927 aa  228  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 908 aa  227  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 908 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.9 
 
 		 908 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.69 
 
 		 908 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 938 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 942 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 967 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 939 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 939 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.42 
 
 		 940 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 945 aa  212  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  52.38 
 
 		 271 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 940 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 946 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 936 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  26.98 
 
 		 941 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 945 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 936 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 838 aa  194  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 945 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 971 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 917 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 974 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 1007 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.34 
 
 		 836 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 921 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.06 
 
 		 959 aa  183  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1035 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 912 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 944 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 888 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1047 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 902 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1013 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 947 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 924 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 967 aa  161  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 1097 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1011 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.28 
 
 		 1109 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 943 aa  156  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1008 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 920 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.81 
 
 		 978 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 998 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 1013 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.62 
 
 		 986 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 998 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>