More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3339 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  99.56 
 
 		 912 aa  1863    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  55.03 
 
 		 885 aa  1001    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 921 aa  1890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 908 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 904 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 901 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 939 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 939 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  32.42 
 
 		 941 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 940 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 976 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  33.51 
 
 		 942 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  32.26 
 
 		 940 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1007 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  31.78 
 
 		 908 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 988 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  30.99 
 
 		 908 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 908 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 988 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  30.89 
 
 		 908 aa  357  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 908 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  32.64 
 
 		 836 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1016 aa  352  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 906 aa  350  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  30.29 
 
 		 960 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 921 aa  334  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  30.65 
 
 		 919 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 915 aa  316  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1010 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 894 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.96 
 
 		 918 aa  300  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 938 aa  299  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 906 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 951 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 951 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 951 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 859 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 911 aa  285  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 943 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  27.7 
 
 		 959 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 948 aa  275  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 924 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 881 aa  263  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 946 aa  261  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 945 aa  260  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 927 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 875 aa  238  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 974 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 888 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 918 aa  224  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 918 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 874 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 875 aa  220  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.46 
 
 		 906 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 882 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 888 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 900 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 881 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 933 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 872 aa  211  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 874 aa  207  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 880 aa  207  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 874 aa  204  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 887 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1013 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 887 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 1097 aa  200  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 947 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 964 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  38.8 
 
 		 312 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 934 aa  198  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 889 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 963 aa  197  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 902 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.52 
 
 		 838 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 944 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01700  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 278 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 945 aa  190  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 838 aa  187  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 964 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 936 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 936 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 878 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 878 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 878 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 926 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 1013 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 934 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 994 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 1074 aa  168  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 892 aa  168  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 880 aa  167  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 943 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 945 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  25.19 
 
 		 972 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 978 aa  152  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 961 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 925 aa  149  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 892 aa  148  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>