More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2085 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 946 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  77.13 
 
 		 908 aa  1427    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  47.43 
 
 		 921 aa  756    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 908 aa  1849    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  99.45 
 
 		 908 aa  1837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  46.11 
 
 		 919 aa  758    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  83.97 
 
 		 908 aa  1527    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 911 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  42.5 
 
 		 924 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  99.67 
 
 		 908 aa  1841    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  41.86 
 
 		 938 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  86.23 
 
 		 906 aa  1574    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  41.2 
 
 		 945 aa  622  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  39.69 
 
 		 906 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 967 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  37.8 
 
 		 918 aa  548  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 971 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 943 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 974 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 940 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 939 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 939 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  33.98 
 
 		 941 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  33.61 
 
 		 940 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 1007 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  33.81 
 
 		 942 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 976 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1010 aa  396  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1016 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  30.03 
 
 		 960 aa  364  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 921 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 912 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  33.73 
 
 		 836 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 908 aa  354  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 885 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  29.9 
 
 		 959 aa  314  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 901 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 904 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 894 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 915 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 961 aa  274  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 951 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 951 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 951 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 943 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 958 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 948 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1097 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.66 
 
 		 970 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.15 
 
 		 1109 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 990 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 934 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  45.18 
 
 		 312 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 878 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 878 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 994 aa  228  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 878 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 859 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 927 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 878 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 988 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 988 aa  224  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 892 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 929 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 963 aa  220  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 914 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 922 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 919 aa  208  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 967 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 924 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 926 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 957 aa  204  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 978 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1074 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  25.05 
 
 		 986 aa  201  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 942 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 964 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 984 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 944 aa  197  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 941 aa  197  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 998 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 982 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 982 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 1011 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1013 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 936 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 936 aa  189  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 875 aa  187  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 945 aa  185  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 945 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.58 
 
 		 927 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 964 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 917 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 943 aa  178  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 888 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 934 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 872 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 986 aa  173  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 874 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 888 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>