267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2126 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 986 aa  1954    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 947 aa  318  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 888 aa  317  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 927 aa  234  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 875 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 894 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 881 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 961 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 908 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 868 aa  194  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 853 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 915 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 868 aa  190  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 885 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 892 aa  181  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 934 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 918 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 904 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 908 aa  178  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.89 
 
 		 908 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 908 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.78 
 
 		 908 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 906 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.29 
 
 		 908 aa  174  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 880 aa  173  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  25.35 
 
 		 919 aa  165  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 918 aa  163  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 945 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.65 
 
 		 906 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 943 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 921 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 836 aa  155  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 888 aa  155  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 936 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 912 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 874 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1074 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 1007 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  24.79 
 
 		 918 aa  151  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 942 aa  149  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 988 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 901 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 988 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 872 aa  148  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 976 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1097 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1009 aa  145  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 1010 aa  144  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 941 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 1006 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  29.63 
 
 		 1109 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 938 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 942 aa  140  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.5 
 
 		 959 aa  137  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 961 aa  137  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.96 
 
 		 838 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 940 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 874 aa  134  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 961 aa  134  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25 
 
 		 992 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  23.9 
 
 		 941 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 859 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  23.46 
 
 		 940 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 838 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 939 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 939 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 914 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 958 aa  127  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 943 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  23.6 
 
 		 968 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 746 aa  124  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 994 aa  124  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 1016 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 926 aa  124  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.71 
 
 		 960 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 951 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  24.19 
 
 		 972 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 934 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 951 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 951 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 878 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 958 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 945 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1011 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 878 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 1036 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 878 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 878 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.18 
 
 		 836 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  35.32 
 
 		 986 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 962 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 993 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 924 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 984 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 948 aa  112  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 1048 aa  112  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 920 aa  111  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 875 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 922 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>