295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03903 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  44.29 
 
 		 943 aa  736    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1074 aa  2216    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  45.31 
 
 		 1097 aa  875    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  46.79 
 
 		 958 aa  820    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  43.1 
 
 		 1109 aa  839    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 914 aa  492  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 919 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 967 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 945 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 924 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 994 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 920 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  30.93 
 
 		 986 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 984 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  31.86 
 
 		 978 aa  376  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 990 aa  354  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 998 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 998 aa  353  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 998 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 987 aa  350  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 998 aa  349  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 982 aa  349  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 982 aa  349  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1006 aa  348  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 984 aa  340  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 944 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 951 aa  317  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 951 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 951 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 948 aa  293  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 961 aa  281  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 894 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 934 aa  251  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 915 aa  244  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 859 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 888 aa  223  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 923 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 853 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 990 aa  211  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1035 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 908 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 934 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.87 
 
 		 908 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.76 
 
 		 908 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.14 
 
 		 908 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 929 aa  194  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 945 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 946 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  38.7 
 
 		 998 aa  189  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 1013 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 1008 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  23.79 
 
 		 918 aa  183  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 906 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 845 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 961 aa  180  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 1048 aa  179  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 1017 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 921 aa  177  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 1011 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 908 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 958 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.04 
 
 		 919 aa  171  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.03 
 
 		 970 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 901 aa  170  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 921 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 938 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 927 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 911 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 912 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  23.97 
 
 		 941 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 939 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 939 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 940 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 976 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 942 aa  161  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 906 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 885 aa  159  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 964 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 936 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 875 aa  158  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 908 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 988 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 892 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 936 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 988 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 974 aa  154  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 924 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 986 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 964 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 874 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 874 aa  151  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 888 aa  151  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 868 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 875 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  22.96 
 
 		 959 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 868 aa  147  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 900 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 872 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  29.66 
 
 		 968 aa  146  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 882 aa  145  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>