More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2407 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 984 aa  2004    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 914 aa  479  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 943 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1097 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.44 
 
 		 1109 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 958 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1074 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 990 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 924 aa  380  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 967 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 923 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  30.75 
 
 		 978 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 982 aa  364  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 982 aa  364  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 990 aa  363  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 998 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 998 aa  361  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 998 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 998 aa  357  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 998 aa  356  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 919 aa  353  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1008 aa  351  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1017 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 944 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 987 aa  325  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1011 aa  323  9.000000000000001e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 951 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 951 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 951 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 948 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1035 aa  271  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 961 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 918 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 961 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 945 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 934 aa  209  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 908 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 874 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 920 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.14 
 
 		 908 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.03 
 
 		 908 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1013 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.57 
 
 		 908 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 978 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 1013 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 845 aa  188  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  34.47 
 
 		 986 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 957 aa  187  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 984 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 1009 aa  184  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 934 aa  181  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 940 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.31 
 
 		 942 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.1 
 
 		 941 aa  177  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 939 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 939 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 894 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.92 
 
 		 940 aa  167  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 963 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 875 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1048 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 1010 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 927 aa  149  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  35.65 
 
 		 906 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  25.38 
 
 		 836 aa  141  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 915 aa  139  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 892 aa  137  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 888 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 859 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 878 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 878 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 878 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  37.28 
 
 		 927 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 878 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 901 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 882 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 925 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 868 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 904 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 885 aa  131  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 911 aa  131  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 947 aa  131  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 870 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 921 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 887 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 912 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 881 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 979 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 868 aa  129  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 931 aa  129  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 880 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 887 aa  128  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 929 aa  128  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 1158 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 875 aa  127  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 908 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 869 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 945 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>