More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03790 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  58.34 
 
 		 1008 aa  1144    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  57.68 
 
 		 998 aa  1165    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 990 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 982 aa  1997    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 967 aa  700    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 982 aa  1997    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 994 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  37.16 
 
 		 986 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 998 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 998 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  37.81 
 
 		 978 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 998 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 998 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 984 aa  545  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 990 aa  531  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 945 aa  522  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 920 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 1017 aa  515  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 924 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 1013 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 944 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1006 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1097 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 961 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 923 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 987 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 1048 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 958 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 1035 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 943 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 1011 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.41 
 
 		 1109 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 914 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 984 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 919 aa  349  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1074 aa  341  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 951 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 951 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 951 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 948 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 961 aa  263  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 934 aa  249  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 894 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 874 aa  220  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 967 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 974 aa  204  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 888 aa  191  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 929 aa  185  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.9 
 
 		 908 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 908 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.61 
 
 		 908 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.17 
 
 		 908 aa  174  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 939 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 939 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 934 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.52 
 
 		 941 aa  169  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 900 aa  164  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 915 aa  164  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 964 aa  160  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 976 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.11 
 
 		 940 aa  158  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 887 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 882 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 887 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 869 aa  155  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 881 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  32.89 
 
 		 1210 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 870 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 964 aa  153  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 938 aa  150  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 892 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 927 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 874 aa  148  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 888 aa  148  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 875 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.27 
 
 		 960 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 874 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  34.63 
 
 		 906 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 1036 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1047 aa  145  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 872 aa  144  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 1240 aa  144  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 926 aa  144  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 859 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 978 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 946 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 931 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 845 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 911 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0809  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 1218 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00325409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 892 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 878 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 933 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.53 
 
 		 836 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  40.76 
 
 		 271 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 918 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 957 aa  131  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>