More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2359 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 915 aa  1868    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 894 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 859 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 875 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 951 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 951 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 951 aa  351  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 892 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 875 aa  329  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 874 aa  327  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1007 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 948 aa  322  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 921 aa  321  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 912 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 976 aa  318  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 869 aa  317  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 870 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 926 aa  315  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 927 aa  314  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 868 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 908 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 845 aa  312  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 868 aa  312  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 988 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 988 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 885 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 888 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 918 aa  305  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 872 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 874 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 874 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 878 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  29.38 
 
 		 940 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  30.22 
 
 		 942 aa  297  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 878 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 878 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 878 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 888 aa  294  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 908 aa  291  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 892 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  28.57 
 
 		 941 aa  290  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 1097 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 939 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 939 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 940 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 880 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 934 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 943 aa  285  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 958 aa  285  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.77 
 
 		 908 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 943 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 914 aa  280  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 880 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  29.18 
 
 		 908 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 908 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  29.02 
 
 		 908 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 961 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.23 
 
 		 960 aa  274  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 906 aa  271  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1010 aa  271  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 904 aa  267  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1016 aa  266  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 853 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 943 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 993 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 942 aa  260  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 994 aa  260  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 882 aa  259  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 941 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 917 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 944 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 984 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  29.41 
 
 		 836 aa  253  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 947 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 901 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 924 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 945 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 936 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.56 
 
 		 970 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 936 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 945 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 998 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 998 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 900 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 998 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  26.49 
 
 		 959 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  24.13 
 
 		 918 aa  244  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 929 aa  244  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1074 aa  244  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 933 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 923 aa  243  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 964 aa  241  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  27.51 
 
 		 927 aa  241  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 920 aa  240  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 998 aa  240  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 881 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1008 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 990 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 987 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 931 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>