More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3737 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 		 967 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 994 aa  2019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  41.81 
 
 		 998 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 		 990 aa  742    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  57.88 
 
 		 986 aa  1169    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  41.51 
 
 		 998 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 		 1017 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 		 990 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  41.26 
 
 		 998 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 984 aa  743    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  39.28 
 
 		 987 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  41.61 
 
 		 998 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  41.6 
 
 		 1013 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  43.95 
 
 		 978 aa  787    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  40.93 
 
 		 944 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 1006 aa  632  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 982 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 982 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  38.58 
 
 		 961 aa  599  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 998 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 945 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1008 aa  549  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 920 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 924 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 923 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 1011 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.83 
 
 		 1109 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 958 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 1048 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 1097 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 1035 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 914 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 919 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1074 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 961 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 934 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 951 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 951 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 951 aa  278  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 948 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 943 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 964 aa  253  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 927 aa  239  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1012 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 908 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.19 
 
 		 908 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 945 aa  221  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.11 
 
 		 908 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 892 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.04 
 
 		 959 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 908 aa  210  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.31 
 
 		 968 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.8 
 
 		 908 aa  205  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 939 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 944 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 984 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 939 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 906 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.19 
 
 		 970 aa  197  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 976 aa  196  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.23 
 
 		 941 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 921 aa  193  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 988 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 946 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 940 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.37 
 
 		 954 aa  187  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  23.35 
 
 		 940 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 901 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1016 aa  184  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 922 aa  184  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 943 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 938 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 1083 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.12 
 
 		 960 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  23.69 
 
 		 942 aa  178  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 1009 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 921 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 1010 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 994 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1007 aa  174  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 894 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 912 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  22.7 
 
 		 919 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.84 
 
 		 836 aa  166  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  41.41 
 
 		 859 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 902 aa  161  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 964 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 915 aa  159  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 892 aa  157  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1047 aa  157  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 881 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  34.8 
 
 		 906 aa  154  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 918 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 924 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 934 aa  153  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 957 aa  152  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1036 aa  151  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 931 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 870 aa  149  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>