More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1893 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  94.93 
 
 		 944 aa  1827    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  48.9 
 
 		 836 aa  769    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  89.77 
 
 		 943 aa  1720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  47.68 
 
 		 838 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  83.73 
 
 		 917 aa  1607    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  42.2 
 
 		 972 aa  745    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  48.23 
 
 		 842 aa  746    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  98.62 
 
 		 942 aa  1891    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 941 aa  1919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 901 aa  615  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 945 aa  581  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 936 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 853 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 935 aa  402  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 946 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 919 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 972 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 938 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 746 aa  318  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 943 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 962 aa  310  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 915 aa  257  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.66 
 
 		 992 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 894 aa  232  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1004 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 859 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 1001 aa  211  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 875 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 917 aa  204  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 880 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.51 
 
 		 908 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.39 
 
 		 908 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 908 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 889 aa  192  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 991 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 908 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  23.74 
 
 		 918 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 908 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 921 aa  181  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 914 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 929 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 936 aa  177  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 976 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 932 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.79 
 
 		 940 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 988 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 845 aa  171  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 933 aa  170  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 988 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 947 aa  164  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 961 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 942 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 874 aa  159  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 918 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 945 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 961 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 868 aa  155  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 1010 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 868 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 944 aa  152  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 923 aa  152  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 945 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 943 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 920 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 904 aa  148  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  23.22 
 
 		 906 aa  148  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 920 aa  147  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 918 aa  147  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  24.95 
 
 		 897 aa  144  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 874 aa  138  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 862 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1035 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 888 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 874 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 897 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1097 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.8 
 
 		 978 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 958 aa  129  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 994 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 1008 aa  128  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 933 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 958 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 943 aa  125  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  27.55 
 
 		 1109 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 998 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1236 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 998 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 984 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 924 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 967 aa  119  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 993 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 925 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 994 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 918 aa  115  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 1013 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>