More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0295 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 964 aa  1976    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  63.3 
 
 		 964 aa  1249    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 1036 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 1047 aa  601  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 900 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 882 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 887 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 887 aa  364  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 881 aa  362  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 878 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 878 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 878 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 869 aa  335  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 878 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 892 aa  335  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 880 aa  333  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 870 aa  327  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 892 aa  327  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 888 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 874 aa  321  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 872 aa  319  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 874 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 874 aa  317  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 859 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 845 aa  310  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 868 aa  295  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 875 aa  294  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 868 aa  292  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 875 aa  290  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 927 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 902 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 926 aa  274  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 889 aa  265  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 978 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 934 aa  258  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 994 aa  255  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 961 aa  252  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 998 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 998 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 998 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 998 aa  245  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 915 aa  237  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 944 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 924 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 951 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.88 
 
 		 941 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.32 
 
 		 940 aa  212  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 951 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 921 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 912 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 948 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1035 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 931 aa  196  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  51.52 
 
 		 271 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1006 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 922 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 908 aa  191  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 885 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 838 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 944 aa  187  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 904 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 945 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.97 
 
 		 908 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 967 aa  184  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.27 
 
 		 836 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 938 aa  180  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 908 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 906 aa  180  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.82 
 
 		 908 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 881 aa  177  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.72 
 
 		 908 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 990 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 894 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1011 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 967 aa  161  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 982 aa  160  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 982 aa  160  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 961 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 1097 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1017 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 1013 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 958 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.99 
 
 		 1109 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 1017 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 1074 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 601 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 998 aa  152  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  36.98 
 
 		 914 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 1011 aa  150  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 943 aa  148  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 951 aa  147  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 990 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 1048 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 945 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 984 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 919 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 987 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 978 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.91 
 
 		 968 aa  141  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 940 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>