257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1289 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 978 aa  2005    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 1083 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 1009 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.21 
 
 		 968 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 881 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 1158 aa  333  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 922 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 880 aa  278  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 918 aa  271  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 951 aa  270  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 951 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 951 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 961 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 888 aa  262  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 958 aa  249  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 904 aa  244  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1013 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 994 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 936 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 936 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 914 aa  231  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 874 aa  227  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 870 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.41 
 
 		 970 aa  222  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 875 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 988 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 988 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.14 
 
 		 940 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 888 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.51 
 
 		 954 aa  213  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 947 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 976 aa  209  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 942 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 900 aa  204  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 906 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 1048 aa  202  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 908 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 993 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 887 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 887 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 881 aa  196  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 939 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 939 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 1007 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 908 aa  195  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.23 
 
 		 908 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.13 
 
 		 908 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.46 
 
 		 941 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 940 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.18 
 
 		 908 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 919 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 967 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 1011 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.5 
 
 		 836 aa  178  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 924 aa  178  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 1010 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 998 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 894 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 984 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1046 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 1013 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  25.97 
 
 		 978 aa  163  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 1008 aa  163  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 1006 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 853 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 979 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1035 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  38.56 
 
 		 927 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 921 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 859 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 915 aa  148  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 990 aa  148  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 912 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 948 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 945 aa  144  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 964 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 982 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 982 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 958 aa  141  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 878 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 944 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 964 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  27.38 
 
 		 986 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 950 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 868 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 1097 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 868 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1074 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 934 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 987 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 918 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 880 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>