More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1603 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  40.86 
 
 		 998 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  40.39 
 
 		 998 aa  670    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 		 994 aa  742    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  45.28 
 
 		 984 aa  810    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  42.73 
 
 		 978 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 990 aa  2011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  42.66 
 
 		 986 aa  732    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  59.62 
 
 		 987 aa  1180    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  40.45 
 
 		 998 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  40.35 
 
 		 998 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  40.89 
 
 		 944 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 1017 aa  618  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 1013 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 961 aa  585  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 1006 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 967 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 1035 aa  542  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 982 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 982 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 1008 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 920 aa  512  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 990 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 998 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 923 aa  499  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 1011 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 1048 aa  489  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 945 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 924 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 914 aa  426  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 943 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 958 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  33.27 
 
 		 1109 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1097 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 919 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 984 aa  350  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1074 aa  349  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 951 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 951 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 948 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 951 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 961 aa  271  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 915 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 927 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 934 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 918 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1012 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 892 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 933 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 845 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 944 aa  170  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.31 
 
 		 927 aa  169  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 888 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 922 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  42.44 
 
 		 892 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 881 aa  160  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.26 
 
 		 954 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 947 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 957 aa  158  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 945 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 931 aa  157  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 943 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 929 aa  155  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 918 aa  154  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 904 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 902 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 1047 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 964 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 934 aa  149  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  33.02 
 
 		 906 aa  148  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 978 aa  148  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 878 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 964 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  41.71 
 
 		 875 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 878 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  22.85 
 
 		 959 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 894 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 900 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  40.19 
 
 		 887 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 939 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 939 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 887 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 908 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  25.03 
 
 		 838 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 1036 aa  141  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 901 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 885 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 859 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 979 aa  138  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 881 aa  137  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  32.39 
 
 		 1210 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 882 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 874 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 		 869 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  44.75 
 
 		 984 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 868 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  38.28 
 
 		 888 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 		 872 aa  135  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  23.27 
 
 		 941 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>