291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1850 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 961 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  40.84 
 
 		 1048 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1035 aa  2108    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  41.32 
 
 		 1006 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 990 aa  542  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 967 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 987 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 984 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 998 aa  506  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.62 
 
 		 978 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 994 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 1017 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  35.02 
 
 		 986 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 990 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 998 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 998 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 998 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 944 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 998 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 982 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 982 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 920 aa  436  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 923 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1011 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 1008 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 945 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 919 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 924 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 914 aa  329  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  30.74 
 
 		 1109 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 958 aa  289  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  40.17 
 
 		 1013 aa  281  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 984 aa  256  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 927 aa  249  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 918 aa  244  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 931 aa  234  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 948 aa  231  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 951 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 951 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 951 aa  224  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 943 aa  221  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 1097 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 882 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 859 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1074 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 892 aa  207  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 934 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 887 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 933 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 887 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 900 aa  201  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 888 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 961 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 993 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1012 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 878 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 929 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.64 
 
 		 954 aa  171  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 957 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 875 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 915 aa  167  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 881 aa  167  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1013 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 944 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  32.78 
 
 		 906 aa  166  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 908 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  26.72 
 
 		 927 aa  163  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 945 aa  162  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 		 868 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1047 aa  160  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 868 aa  158  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 1036 aa  155  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 1009 aa  154  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 978 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 881 aa  152  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 976 aa  151  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 979 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 875 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 963 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 869 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 874 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 889 aa  147  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 946 aa  146  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 870 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 874 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 874 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 906 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 894 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 988 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 888 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 988 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 1007 aa  142  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 926 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 964 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 964 aa  141  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.82 
 
 		 968 aa  141  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 880 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>