More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1097 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  92.64 
 
 		 870 aa  1646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  70.75 
 
 		 872 aa  1250    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  70.63 
 
 		 874 aa  1246    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  72.11 
 
 		 874 aa  1287    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  44.36 
 
 		 892 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  74.45 
 
 		 880 aa  1333    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  47.87 
 
 		 882 aa  822    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  49.89 
 
 		 881 aa  850    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  71.66 
 
 		 888 aa  1272    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  49.22 
 
 		 887 aa  848    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  50.11 
 
 		 887 aa  846    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  71.32 
 
 		 874 aa  1257    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 869 aa  1774    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  49.55 
 
 		 900 aa  855    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 845 aa  455  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 859 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 892 aa  446  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 878 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 878 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 878 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 878 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 875 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  38.17 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 868 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 868 aa  369  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 875 aa  363  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 927 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 926 aa  356  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 964 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 964 aa  336  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 915 aa  319  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 902 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 894 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 1047 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 889 aa  291  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  62.45 
 
 		 271 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 918 aa  264  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 967 aa  261  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 958 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 880 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 920 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 919 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 933 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 994 aa  231  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 978 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 904 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 931 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 929 aa  224  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 924 aa  221  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 945 aa  207  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 881 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 885 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 944 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.54 
 
 		 908 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 936 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 936 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 836 aa  190  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 838 aa  190  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 938 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 901 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 963 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 853 aa  181  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 1036 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 934 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 943 aa  168  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  44.16 
 
 		 1017 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 1097 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 967 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.45 
 
 		 838 aa  167  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 842 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  34.08 
 
 		 1109 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 982 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 982 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 998 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 998 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 998 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 998 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1008 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 945 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1013 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 990 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 998 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 951 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 914 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 958 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  36.98 
 
 		 978 aa  156  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 948 aa  155  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 923 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 951 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 951 aa  154  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  39.27 
 
 		 1035 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 994 aa  150  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  24.05 
 
 		 972 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  34.11 
 
 		 986 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 906 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 957 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 921 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 1017 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 961 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 917 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>