More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3121 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  50.5 
 
 		 874 aa  831    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  50.11 
 
 		 874 aa  843    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 887 aa  1818    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  82.98 
 
 		 881 aa  1541    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  49.66 
 
 		 870 aa  862    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  49.22 
 
 		 869 aa  845    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  83.2 
 
 		 882 aa  1555    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  50.17 
 
 		 872 aa  836    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  46.06 
 
 		 880 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  50.22 
 
 		 888 aa  845    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  99.21 
 
 		 887 aa  1805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  83.99 
 
 		 900 aa  1577    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  51.17 
 
 		 874 aa  848    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  43.12 
 
 		 892 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 845 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 878 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 892 aa  422  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 878 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 878 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 878 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 859 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 964 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 964 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 927 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 875 aa  350  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 601 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 875 aa  333  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 868 aa  328  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 868 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 894 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 926 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 889 aa  292  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1036 aa  286  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  65.18 
 
 		 271 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 902 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 951 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 951 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 951 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 948 aa  250  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 961 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 919 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 881 aa  219  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 931 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.79 
 
 		 940 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 921 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 942 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 978 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 908 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 912 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1035 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 901 aa  200  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 940 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.16 
 
 		 968 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 984 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.31 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 904 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 939 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 945 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 943 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 838 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 885 aa  190  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 939 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  25.91 
 
 		 959 aa  187  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.09 
 
 		 836 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.45 
 
 		 960 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.31 
 
 		 908 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 908 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 944 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 938 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 988 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  47.03 
 
 		 1047 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 988 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 836 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 945 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  43.67 
 
 		 1017 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 1013 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 982 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 982 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  39.24 
 
 		 998 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 967 aa  162  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  39.34 
 
 		 1008 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 946 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  35.69 
 
 		 978 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  40.26 
 
 		 986 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 934 aa  157  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 1006 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.12 
 
 		 1109 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 943 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 945 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.72 
 
 		 838 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 924 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 915 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 1017 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 880 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 958 aa  151  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 942 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 906 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 		 994 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 990 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1097 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>