More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04315 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 838 aa  1718    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 894 aa  237  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 888 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 951 aa  231  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 951 aa  230  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 859 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 951 aa  229  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 927 aa  227  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 915 aa  225  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 948 aa  223  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 918 aa  217  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 1097 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 875 aa  207  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 908 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 878 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 878 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 878 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 933 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 874 aa  203  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 878 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 934 aa  201  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 947 aa  200  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 868 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 875 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 882 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 887 aa  197  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 921 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 912 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1279  rhodanese-like protein  24.48 
 
 		 990 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 869 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 872 aa  194  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 887 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 868 aa  194  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 925 aa  194  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 892 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 964 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 998 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 880 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 919 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 874 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 870 aa  187  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 900 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 964 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 888 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 936 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 936 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 881 aa  181  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 921 aa  180  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 880 aa  178  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 845 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 943 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 911 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 931 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 943 aa  172  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.06 
 
 		 906 aa  171  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 892 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 938 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 924 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 881 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.22 
 
 		 940 aa  168  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.97 
 
 		 919 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 929 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 874 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 920 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 926 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 987 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 902 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 945 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 904 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 957 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 994 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 906 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  23.65 
 
 		 927 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 936 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 1007 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 994 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 853 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 842 aa  151  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 934 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 836 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  25.05 
 
 		 978 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 901 aa  147  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 945 aa  146  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 889 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 944 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 998 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 998 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 998 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1035 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 944 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.52 
 
 		 838 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 917 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  24.91 
 
 		 972 aa  131  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 939 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 958 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 922 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 939 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  22.99 
 
 		 959 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.36 
 
 		 908 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.16 
 
 		 954 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>