299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0304 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  74.02 
 
 		 870 aa  1346    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  62.97 
 
 		 874 aa  1107    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  63.77 
 
 		 872 aa  1123    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  63.17 
 
 		 874 aa  1118    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  45.01 
 
 		 900 aa  776    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  46.28 
 
 		 887 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  45.5 
 
 		 881 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  44.82 
 
 		 882 aa  758    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 880 aa  1806    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  74.45 
 
 		 869 aa  1342    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  62.3 
 
 		 888 aa  1129    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  46.06 
 
 		 887 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  63.43 
 
 		 874 aa  1124    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  42.78 
 
 		 892 aa  622  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 892 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 845 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 859 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  33.41 
 
 		 878 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 878 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  33.41 
 
 		 878 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  33.41 
 
 		 878 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 875 aa  350  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 964 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 927 aa  340  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 875 aa  340  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 964 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 926 aa  320  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 868 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 868 aa  313  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 894 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 902 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 915 aa  285  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 889 aa  267  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 943 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 958 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 951 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 951 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 914 aa  251  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 880 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 920 aa  242  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 918 aa  239  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 919 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 967 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  51.16 
 
 		 271 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 994 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  27.73 
 
 		 906 aa  228  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 929 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 904 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 881 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 993 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 945 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 921 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 912 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 924 aa  207  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 987 aa  202  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 885 aa  201  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 938 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 936 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 936 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 944 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.36 
 
 		 908 aa  194  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.95 
 
 		 927 aa  193  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 963 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 838 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 967 aa  177  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.75 
 
 		 908 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.21 
 
 		 836 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 925 aa  173  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 1013 aa  171  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.07 
 
 		 838 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 853 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 1047 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 1036 aa  169  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 836 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 842 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 934 aa  163  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 950 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 1097 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 971 aa  158  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  34.07 
 
 		 1109 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 917 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  22.98 
 
 		 972 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 944 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 923 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 945 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.04 
 
 		 978 aa  147  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 951 aa  145  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 938 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1017 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 958 aa  144  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 1008 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 998 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 1035 aa  140  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 948 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 998 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 961 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 998 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 998 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>