More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1862 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  58.83 
 
 		 888 aa  1006    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 947 aa  1900    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 986 aa  319  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 859 aa  268  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 894 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 918 aa  258  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 915 aa  257  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 914 aa  247  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 961 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 951 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 951 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 951 aa  243  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 875 aa  240  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 881 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 948 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 868 aa  231  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 868 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 927 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 908 aa  224  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 888 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 925 aa  221  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 892 aa  218  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 978 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 919 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 872 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 874 aa  213  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 874 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 984 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 869 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 933 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 921 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 931 aa  204  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 923 aa  204  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 874 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 838 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 922 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 836 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 912 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 885 aa  197  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 904 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 998 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 964 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 880 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 998 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 998 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 945 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 945 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 964 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 936 aa  182  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 924 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 917 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 943 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 1006 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 944 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 943 aa  177  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26 
 
 		 838 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 990 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 842 aa  174  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 998 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 944 aa  172  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 961 aa  171  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 942 aa  171  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 941 aa  171  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.7 
 
 		 906 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 921 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 1035 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.24 
 
 		 908 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 945 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  22.92 
 
 		 970 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 906 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.17 
 
 		 919 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 946 aa  152  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1097 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 984 aa  148  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.96 
 
 		 1109 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 942 aa  147  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 926 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 938 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 862 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 918 aa  141  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 958 aa  140  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 939 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.03 
 
 		 959 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 939 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  22.23 
 
 		 1011 aa  138  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 940 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.97 
 
 		 941 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.56 
 
 		 940 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 875 aa  135  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 943 aa  134  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.11 
 
 		 992 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 845 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 934 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 892 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 601 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>