More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1180 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  41.91 
 
 		 994 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 998 aa  2037    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 944 aa  1927    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 990 aa  682    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  99.8 
 
 		 998 aa  2033    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  45.08 
 
 		 984 aa  778    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  40.61 
 
 		 1011 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  39.2 
 
 		 986 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  40.84 
 
 		 1017 aa  716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 987 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  99.6 
 
 		 998 aa  2031    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 1013 aa  936    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  67.63 
 
 		 978 aa  1368    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  83.77 
 
 		 998 aa  1759    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 1006 aa  594  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 		 961 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 967 aa  568  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 990 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 982 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 982 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  36.06 
 
 		 998 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 1008 aa  522  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1048 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 945 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 920 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 		 924 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 1035 aa  485  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 923 aa  479  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1097 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 914 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 958 aa  413  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 919 aa  360  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 984 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1074 aa  350  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 961 aa  300  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 943 aa  261  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  40.18 
 
 		 1109 aa  261  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 948 aa  260  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 894 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 915 aa  245  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 964 aa  245  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 964 aa  224  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 922 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 927 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 908 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 933 aa  203  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 938 aa  200  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 944 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 888 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 875 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.83 
 
 		 908 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 902 aa  191  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.47 
 
 		 968 aa  190  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 946 aa  189  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 967 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  26.7 
 
 		 954 aa  183  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 993 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 947 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  24.04 
 
 		 970 aa  177  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 994 aa  177  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1009 aa  177  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 901 aa  174  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  23.98 
 
 		 919 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 951 aa  167  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 951 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 881 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 951 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 859 aa  164  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 976 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  41.03 
 
 		 900 aa  155  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 943 aa  155  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 878 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  23.14 
 
 		 941 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 870 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 878 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 878 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 988 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  21.96 
 
 		 959 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 878 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 869 aa  152  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 988 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 1047 aa  151  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 892 aa  151  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  41.96 
 
 		 892 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1013 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 882 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.18 
 
 		 960 aa  149  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 874 aa  148  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 872 aa  147  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 881 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  42.57 
 
 		 271 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 1007 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 888 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 845 aa  144  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 874 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 939 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 939 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 874 aa  141  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>