293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3698 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 961 aa  1963    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 1035 aa  687    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 1048 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  65.03 
 
 		 1006 aa  1265    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  40.98 
 
 		 978 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  38.48 
 
 		 994 aa  605  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 990 aa  595  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  39.32 
 
 		 998 aa  591  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 998 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 998 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 998 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 984 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 1017 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  38.38 
 
 		 944 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  37.85 
 
 		 967 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 		 986 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 990 aa  536  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 1013 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 987 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 945 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 982 aa  489  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 982 aa  489  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 		 920 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 924 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1008 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 998 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 923 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 914 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 958 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.03 
 
 		 1109 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 919 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 951 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 951 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 951 aa  271  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 918 aa  268  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 961 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1011 aa  245  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 964 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 1097 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 948 aa  225  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 934 aa  225  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 943 aa  224  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 984 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 933 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 888 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 880 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.64 
 
 		 919 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 908 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  37.54 
 
 		 1074 aa  178  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 845 aa  178  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 921 aa  176  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 976 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 957 aa  166  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  38.57 
 
 		 931 aa  164  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.22 
 
 		 908 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.45 
 
 		 908 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 1047 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 		 859 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 908 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 892 aa  161  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 1010 aa  161  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 964 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 1009 aa  160  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 906 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  37.28 
 
 		 906 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 908 aa  156  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 927 aa  154  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 875 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.48 
 
 		 960 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 887 aa  149  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 894 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 1016 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 878 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 875 aa  149  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 878 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 878 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 878 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 887 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 885 aa  147  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 870 aa  147  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1036 aa  147  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 929 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 869 aa  145  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 868 aa  145  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 900 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 868 aa  142  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 836 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 882 aa  139  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 926 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 915 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 880 aa  138  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 874 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 986 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 934 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 874 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 888 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1017 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 892 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>