237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2048 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  43.13 
 
 		 950 aa  757    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 944 aa  1923    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  49.18 
 
 		 927 aa  899    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  44.94 
 
 		 954 aa  790    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  66.42 
 
 		 936 aa  1248    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  66.53 
 
 		 936 aa  1250    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  46.8 
 
 		 922 aa  801    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  81.88 
 
 		 945 aa  1588    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 918 aa  328  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 881 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 880 aa  271  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  27.17 
 
 		 968 aa  264  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 951 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 951 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 951 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 894 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 943 aa  239  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 948 aa  229  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 915 aa  224  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 958 aa  204  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 914 aa  201  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 994 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1009 aa  200  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 998 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 998 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 998 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 912 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 878 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 869 aa  194  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 878 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 880 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 921 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 927 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 964 aa  187  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 908 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 919 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 875 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 892 aa  183  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 926 aa  183  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 874 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 868 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 882 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 845 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 887 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 902 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 887 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  24.3 
 
 		 970 aa  175  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 944 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 900 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 990 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 964 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.18 
 
 		 906 aa  168  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 1035 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 1012 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 918 aa  166  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 1007 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 988 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 988 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 942 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 976 aa  155  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 944 aa  155  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.14 
 
 		 838 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 941 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 1013 aa  151  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 963 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 917 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 987 aa  148  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 938 aa  147  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 942 aa  146  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 943 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  23.19 
 
 		 941 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 994 aa  145  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1097 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 901 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 993 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 934 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 978 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  39.64 
 
 		 1013 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 958 aa  140  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  23.16 
 
 		 940 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 1016 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 838 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 984 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 842 aa  136  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  22.23 
 
 		 943 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 889 aa  134  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1158 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 904 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 1083 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 945 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 979 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 1017 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 1010 aa  128  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 859 aa  127  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  40.09 
 
 		 978 aa  127  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 870 aa  125  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 967 aa  125  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  23.3 
 
 		 836 aa  124  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 998 aa  124  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>