More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1144 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  41.61 
 
 		 994 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  83.77 
 
 		 998 aa  1741    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  68.33 
 
 		 978 aa  1365    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  40.86 
 
 		 990 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 998 aa  2031    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  83.67 
 
 		 998 aa  1737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 1011 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  38.46 
 
 		 986 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 1017 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  45.75 
 
 		 984 aa  785    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  40.45 
 
 		 987 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  83.77 
 
 		 998 aa  1739    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  50.34 
 
 		 1013 aa  943    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  84.85 
 
 		 944 aa  1665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 1006 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 961 aa  585  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  37.48 
 
 		 967 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 990 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 982 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 982 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 998 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1008 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1048 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1035 aa  506  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 920 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 945 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 924 aa  482  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 923 aa  475  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 914 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.74 
 
 		 1109 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 919 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 984 aa  350  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 961 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  41.13 
 
 		 1097 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 951 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 951 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 951 aa  266  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 894 aa  266  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  40.99 
 
 		 958 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 948 aa  252  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 943 aa  251  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 964 aa  238  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 915 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 927 aa  220  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 908 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.86 
 
 		 968 aa  195  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 933 aa  194  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  38.7 
 
 		 1074 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 945 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.31 
 
 		 954 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 978 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 946 aa  175  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 934 aa  175  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  23.87 
 
 		 919 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 901 aa  171  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 881 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.69 
 
 		 970 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 994 aa  167  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 947 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 988 aa  161  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 		 859 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 1007 aa  154  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 870 aa  152  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1047 aa  152  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 869 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 964 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 900 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 845 aa  149  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  22.65 
 
 		 959 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 875 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 892 aa  148  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 918 aa  147  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 878 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 878 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 878 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 878 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 874 aa  145  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 881 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  37.83 
 
 		 882 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  31.83 
 
 		 906 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 892 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  32.17 
 
 		 1210 aa  141  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 880 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 874 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 888 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 874 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 1017 aa  139  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 889 aa  138  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1036 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 1240 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 887 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 887 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 868 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 1011 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  40.56 
 
 		 271 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 931 aa  134  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 908 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 922 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>