246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01579 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  100 
 
 
889 aa  1816    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 
875 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 
868 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 
868 aa  452  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 
926 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 
927 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 
892 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
859 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 
902 aa  340  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 
875 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 
874 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 
878 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 
878 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 
878 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 
878 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 
887 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
874 aa  294  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 
887 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
900 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 
882 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
870 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
869 aa  280  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 
881 aa  280  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 
872 aa  271  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
874 aa  266  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
892 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 
964 aa  264  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
880 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
845 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
915 aa  238  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
918 aa  208  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25 
 
 
904 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 
888 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
951 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
951 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
885 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
951 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 
921 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 
912 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
881 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
919 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 
888 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
948 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25 
 
 
906 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 
922 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  23.62 
 
 
919 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
906 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
938 aa  175  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 
1047 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
908 aa  168  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 
964 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
908 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.12 
 
 
908 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.14 
 
 
908 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.07 
 
 
908 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
853 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
945 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 
925 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 
945 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
946 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  43.46 
 
 
1036 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 
1035 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
936 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
936 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
939 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  39.58 
 
 
271 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 
1013 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
939 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
950 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 
943 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
944 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.37 
 
 
941 aa  138  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
934 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
998 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  30.67 
 
 
1109 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 
914 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 
838 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
601 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  30.7 
 
 
978 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 
998 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 
945 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 
998 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
1011 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
945 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 
924 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  22.9 
 
 
940 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 
998 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 
984 aa  131  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
894 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
957 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
944 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 
901 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 
958 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 
923 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 
987 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 
982 aa  127  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 
982 aa  127  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 
942 aa  127  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
994 aa  127  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
967 aa  127  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>