281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2831 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 984 aa  675    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 		 994 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 998 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  40.75 
 
 		 998 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  40.36 
 
 		 998 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  43.01 
 
 		 986 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1017 aa  2080    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  41.19 
 
 		 944 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  40.56 
 
 		 998 aa  710    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  41.99 
 
 		 978 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 1013 aa  632  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 990 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  37.94 
 
 		 1006 aa  599  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 987 aa  593  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 		 961 aa  571  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 1011 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 967 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 990 aa  524  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 982 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 982 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 998 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 1035 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 945 aa  505  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 1048 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 924 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 1008 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 914 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 943 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 919 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 984 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  43.41 
 
 		 920 aa  280  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 923 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  39.22 
 
 		 1109 aa  265  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 1097 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 958 aa  252  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  42.9 
 
 		 961 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 892 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 948 aa  191  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  37.46 
 
 		 951 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 951 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 1074 aa  179  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 951 aa  178  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 922 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1009 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 874 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  35.95 
 
 		 906 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 934 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 1047 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 933 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 964 aa  160  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.47 
 
 		 992 aa  158  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 902 aa  157  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 900 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 887 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 887 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 964 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 927 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 915 aa  151  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 918 aa  151  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  32.92 
 
 		 1210 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 931 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 882 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 870 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 869 aa  145  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 878 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 878 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 878 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 881 aa  144  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 958 aa  144  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 878 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.56 
 
 		 960 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  28.41 
 
 		 959 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  37.83 
 
 		 927 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1036 aa  142  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 894 aa  141  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  42.66 
 
 		 957 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 872 aa  140  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 875 aa  140  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 874 aa  140  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 888 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  39.9 
 
 		 925 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 874 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 859 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 868 aa  134  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 908 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 911 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 929 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1240 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 845 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1158 aa  131  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 984 aa  131  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  39.91 
 
 		 954 aa  131  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 868 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 934 aa  130  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  38.2 
 
 		 892 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 967 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 943 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 875 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 880 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 963 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>