274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0224 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  42.27 
 
 		 931 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  44.69 
 
 		 929 aa  693    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 918 aa  1855    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  40.75 
 
 		 957 aa  622  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  38.31 
 
 		 906 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 933 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 915 aa  302  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 958 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 925 aa  277  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 875 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 892 aa  270  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 961 aa  267  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 878 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 878 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 878 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 878 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 919 aa  263  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 977 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 914 aa  259  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1097 aa  258  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 868 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 869 aa  255  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 924 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 947 aa  250  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 908 aa  250  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  27.59 
 
 		 940 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 888 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 872 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 934 aa  249  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 888 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 942 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27 
 
 		 941 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 939 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1035 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 939 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 988 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 874 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 979 aa  242  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 940 aa  240  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 943 aa  239  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 984 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 988 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 967 aa  238  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 874 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 880 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1007 aa  235  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 945 aa  234  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 1016 aa  231  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 922 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 976 aa  229  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  26.44 
 
 		 918 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 984 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 912 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 921 aa  224  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 998 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 998 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  26.12 
 
 		 960 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 923 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 1011 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 998 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  27.28 
 
 		 836 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1009 aa  214  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 838 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 881 aa  213  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 885 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 902 aa  210  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 881 aa  210  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 1047 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 990 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 1010 aa  207  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 950 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.2 
 
 		 927 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 944 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 901 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 900 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.4 
 
 		 970 aa  197  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 942 aa  197  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 894 aa  194  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 924 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  38.59 
 
 		 1109 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.25 
 
 		 954 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 880 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 918 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 961 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 1013 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 936 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  36.78 
 
 		 986 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 936 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 		 951 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1013 aa  168  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 948 aa  168  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 951 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 945 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 944 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1046 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  36.31 
 
 		 1006 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 958 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 904 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 990 aa  164  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>