260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2242 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  43.59 
 
 		 922 aa  735    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 950 aa  1934    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  52.94 
 
 		 927 aa  965    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  44.89 
 
 		 954 aa  773    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  42.49 
 
 		 944 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  43.66 
 
 		 945 aa  776    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  45 
 
 		 936 aa  791    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 936 aa  789    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 881 aa  331  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 918 aa  330  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 880 aa  277  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  27.32 
 
 		 968 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 958 aa  242  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 951 aa  221  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 951 aa  220  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 951 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 927 aa  217  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 918 aa  209  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 948 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 859 aa  195  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 993 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 875 aa  189  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 902 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 914 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 979 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 934 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 923 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 874 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 967 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 924 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  25.02 
 
 		 978 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 921 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 853 aa  171  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 888 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.75 
 
 		 906 aa  168  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 872 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 901 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 911 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 880 aa  159  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  25.12 
 
 		 918 aa  156  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  22.55 
 
 		 940 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 904 aa  155  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 988 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 885 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 988 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.55 
 
 		 970 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 894 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 874 aa  144  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 1047 aa  144  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 1083 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.17 
 
 		 960 aa  141  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 963 aa  140  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 878 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1013 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 878 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 1009 aa  138  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 878 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 934 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 915 aa  137  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 978 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 878 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 889 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 924 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1158 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 990 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 958 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 938 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 947 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  30.54 
 
 		 986 aa  128  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  29.4 
 
 		 1109 aa  128  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  44.9 
 
 		 984 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 1097 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 888 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 925 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 1048 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 977 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 1013 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 929 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 1017 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 943 aa  117  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 994 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 1034 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 961 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 919 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 998 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 945 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1008 aa  115  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 870 aa  114  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 990 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 984 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 964 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 882 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 998 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 998 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 998 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 900 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 845 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 1017 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 908 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>