More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1838 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 979 aa  1994    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  50.74 
 
 		 977 aa  917    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 918 aa  245  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 914 aa  240  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 927 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 929 aa  228  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 931 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 892 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 922 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 943 aa  201  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 915 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 957 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 987 aa  194  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 945 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 961 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 950 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 888 aa  182  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.51 
 
 		 906 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 933 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.34 
 
 		 940 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  24.59 
 
 		 954 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 943 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.17 
 
 		 942 aa  162  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 1011 aa  160  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 925 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 939 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 939 aa  157  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 936 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 978 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 936 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 1035 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 963 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 945 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 944 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  25.95 
 
 		 836 aa  145  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1013 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 836 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  28.91 
 
 		 927 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.32 
 
 		 968 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 990 aa  138  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  41.59 
 
 		 845 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1083 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.92 
 
 		 1109 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 880 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 958 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 875 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 874 aa  132  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 958 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 918 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 859 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 964 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 872 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.33 
 
 		 960 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 951 aa  129  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 951 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 951 aa  128  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 1036 aa  128  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 869 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1158 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 919 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 984 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 948 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 870 aa  125  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 880 aa  124  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 874 aa  124  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 874 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 888 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  34.5 
 
 		 908 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 993 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 868 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 908 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 1097 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 1047 aa  121  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 934 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 964 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 920 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 944 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 868 aa  119  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 998 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 998 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 875 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  34.52 
 
 		 908 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 998 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 908 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1046 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1013 aa  118  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  34.26 
 
 		 908 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 900 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.81 
 
 		 970 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 882 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 911 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 878 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 906 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 921 aa  115  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 881 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 894 aa  115  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1009 aa  115  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 1008 aa  114  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 878 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 878 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>