283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2123 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 925 aa  1893    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 918 aa  281  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 894 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 931 aa  262  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 859 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 927 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 892 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 880 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 929 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 875 aa  237  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 957 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 888 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 915 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 947 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 912 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 904 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 881 aa  207  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 885 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 998 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.7 
 
 		 960 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 875 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 922 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 967 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 1007 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.46 
 
 		 940 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 838 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 902 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 874 aa  181  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 917 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 951 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 951 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 951 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 943 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 943 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 880 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 948 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 933 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 979 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  33.44 
 
 		 906 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 889 aa  158  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 934 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  23.32 
 
 		 972 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 943 aa  155  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  34.49 
 
 		 1109 aa  155  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 919 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  39.81 
 
 		 958 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 921 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 961 aa  144  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 1097 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 878 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 878 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 878 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 878 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1008 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 920 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 977 aa  139  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 908 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 926 aa  137  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  39.46 
 
 		 923 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  43.98 
 
 		 914 aa  135  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  37.79 
 
 		 927 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 924 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 984 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  38.83 
 
 		 986 aa  131  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 1017 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 934 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  41.05 
 
 		 990 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 1013 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 990 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  29.76 
 
 		 968 aa  128  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 964 aa  128  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 984 aa  128  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 882 aa  127  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 946 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 1048 aa  127  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 1035 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 938 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1074 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  39.01 
 
 		 958 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 976 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 978 aa  125  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 1036 aa  125  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 994 aa  124  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  31.51 
 
 		 908 aa  124  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 1011 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  31.51 
 
 		 908 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 945 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 908 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 900 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  39.32 
 
 		 978 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 944 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 967 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1047 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  40.49 
 
 		 970 aa  121  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  38.16 
 
 		 998 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 982 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 982 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 998 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 998 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  28.53 
 
 		 919 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>