More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2111 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  49.02 
 
 		 842 aa  756    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  83.84 
 
 		 943 aa  1600    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  84.39 
 
 		 944 aa  1612    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  48.53 
 
 		 838 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  48.35 
 
 		 836 aa  756    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  41.88 
 
 		 972 aa  744    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 917 aa  1867    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  83.86 
 
 		 942 aa  1605    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  83.73 
 
 		 941 aa  1607    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 901 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 945 aa  585  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 936 aa  525  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 853 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 935 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 919 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 946 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 938 aa  347  8.999999999999999e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 746 aa  320  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 962 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 943 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 961 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 915 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 894 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.69 
 
 		 992 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 972 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1004 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1001 aa  226  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 917 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 859 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 880 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 889 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 875 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 878 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 878 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 878 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 878 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 929 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 908 aa  183  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 920 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 918 aa  181  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 914 aa  178  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.52 
 
 		 908 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.05 
 
 		 940 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.53 
 
 		 908 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 925 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 908 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 885 aa  173  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 947 aa  173  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 868 aa  172  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.18 
 
 		 908 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.18 
 
 		 919 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 906 aa  171  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 940 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 961 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 		 942 aa  170  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 921 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 988 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 874 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 988 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 939 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 939 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 892 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 943 aa  162  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 945 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 984 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 920 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  22.83 
 
 		 959 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 862 aa  151  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 944 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 872 aa  149  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 923 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 888 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 957 aa  144  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 869 aa  144  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 874 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 1010 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 874 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 932 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 838 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 987 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 990 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 933 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 1016 aa  130  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 1035 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 958 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 958 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  22.38 
 
 		 836 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1097 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.31 
 
 		 978 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 943 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 998 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 998 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1008 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  27.88 
 
 		 1109 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 998 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 1236 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 918 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>