274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4082 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 904 aa  1846    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 901 aa  586  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 885 aa  505  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 921 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 912 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 908 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 906 aa  312  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 976 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 908 aa  302  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 988 aa  301  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 988 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  28.13 
 
 		 940 aa  297  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 943 aa  296  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 908 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  28.47 
 
 		 908 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  28.36 
 
 		 908 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  29.25 
 
 		 919 aa  293  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 940 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 939 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 939 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  27.75 
 
 		 942 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  28.68 
 
 		 908 aa  281  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  28.31 
 
 		 941 aa  280  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 1007 aa  277  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 938 aa  277  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.44 
 
 		 960 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.93 
 
 		 970 aa  273  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 945 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 927 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 859 aa  269  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 915 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  29.13 
 
 		 918 aa  266  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 961 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 951 aa  265  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01700  TonB-dependent receptor  49.64 
 
 		 278 aa  262  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 951 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 951 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 946 aa  261  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 934 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 892 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  29.61 
 
 		 836 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 894 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 978 aa  255  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 911 aa  255  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1010 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 906 aa  253  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 914 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 921 aa  245  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 875 aa  245  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 880 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 881 aa  244  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  26 
 
 		 959 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 967 aa  237  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 870 aa  235  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 926 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 1016 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 869 aa  230  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 963 aa  230  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 925 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 868 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 948 aa  225  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 868 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 971 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 924 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 974 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 888 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 922 aa  210  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1013 aa  210  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 918 aa  210  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 934 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 889 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 943 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 882 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1046 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 902 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.48 
 
 		 906 aa  195  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 900 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 887 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 887 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1036 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 964 aa  187  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 958 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1009 aa  184  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 947 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 957 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 1047 aa  181  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  23.35 
 
 		 986 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 994 aa  177  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 946 aa  172  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 919 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 998 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.7 
 
 		 1109 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 918 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 1008 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 990 aa  157  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 836 aa  157  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.67 
 
 		 838 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 950 aa  154  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 936 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 838 aa  153  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>