More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0288 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  57.62 
 
 		 957 aa  1062    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 929 aa  1899    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  57.65 
 
 		 931 aa  1043    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  43.8 
 
 		 918 aa  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  36.88 
 
 		 906 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 933 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 894 aa  324  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 927 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 859 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 925 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 915 aa  240  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 875 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 979 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 870 aa  234  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 880 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 977 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 869 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 892 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 880 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 872 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 908 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.91 
 
 		 908 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 919 aa  221  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.68 
 
 		 908 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 885 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 987 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 888 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 934 aa  213  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 836 aa  209  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 911 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.42 
 
 		 941 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 920 aa  208  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 939 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 939 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 921 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.25 
 
 		 942 aa  205  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 874 aa  204  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 881 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.24 
 
 		 838 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 908 aa  199  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 943 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 906 aa  197  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.35 
 
 		 940 aa  194  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 881 aa  193  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 842 aa  192  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 923 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 982 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 982 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 1074 aa  191  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 993 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 924 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 1035 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 922 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 934 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 917 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.16 
 
 		 927 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 941 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 944 aa  179  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 958 aa  178  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1013 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 1097 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 948 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 1011 aa  171  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 963 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 1008 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  25.37 
 
 		 972 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 951 aa  167  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.05 
 
 		 836 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  39.03 
 
 		 1109 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 951 aa  166  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  24.13 
 
 		 970 aa  165  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 990 aa  164  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 901 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 943 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 838 aa  161  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 961 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 945 aa  158  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 1011 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  36.71 
 
 		 986 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 878 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 878 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 914 aa  151  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 878 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1048 aa  150  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 878 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 936 aa  149  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 935 aa  148  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 845 aa  147  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 984 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 936 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 994 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 875 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 990 aa  146  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 961 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 1013 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1006 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 908 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>