More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2369 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 936 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1868    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 945 aa  472  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 901 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 943 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 917 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  31.77 
 
 		 972 aa  422  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 942 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 944 aa  412  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 941 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 853 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 842 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 836 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  31.59 
 
 		 838 aa  363  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 946 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 938 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 919 aa  292  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 746 aa  285  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 962 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 943 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 972 aa  211  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 948 aa  188  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 951 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 951 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 951 aa  173  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 894 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 920 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 1001 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 917 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 933 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 932 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.39 
 
 		 960 aa  160  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 880 aa  157  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 888 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 868 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 991 aa  149  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 859 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 868 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 924 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 929 aa  145  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 862 aa  141  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 906 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1004 aa  138  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 874 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 845 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 874 aa  134  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 869 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 931 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 904 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 872 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 920 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 888 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31 
 
 		 992 aa  127  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 870 aa  126  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 918 aa  125  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 874 aa  124  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 963 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 915 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 993 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1011 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 961 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 911 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 887 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 887 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 1097 aa  114  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  27.27 
 
 		 1109 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 958 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 908 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 1074 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  30.03 
 
 		 968 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 880 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 943 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1013 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  27.85 
 
 		 986 aa  100  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 919 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 889 aa  99.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 986 aa  99.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 961 aa  99  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  28.01 
 
 		 970 aa  98.2  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  23.91 
 
 		 836 aa  97.8  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 914 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27.2 
 
 		 941 aa  94.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 934 aa  94.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 892 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 918 aa  93.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 984 aa  93.6  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 942 aa  92.8  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 940 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 946 aa  91.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 875 aa  92  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1090 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 924 aa  91.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 957 aa  91.3  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 945 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 957 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 939 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 939 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  28.87 
 
 		 1210 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1036 aa  89.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>