More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1368 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  41.12 
 
 
972 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  62.98 
 
 
938 aa  1219    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  100 
 
 
962 aa  1961    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  40.65 
 
 
946 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  41.15 
 
 
919 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 
936 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 
943 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 
961 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
941 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
917 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
943 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
942 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
944 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  28.39 
 
 
901 aa  327  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.25 
 
 
972 aa  321  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  30.07 
 
 
838 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 
842 aa  315  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
853 aa  299  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
836 aa  291  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
945 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
935 aa  273  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
1001 aa  271  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
917 aa  268  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
1004 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
746 aa  234  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
991 aa  225  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 
932 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
948 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.28 
 
 
992 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
888 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
1097 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 
931 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
927 aa  151  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 
962 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 
933 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
920 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 
931 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
889 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 
915 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 
859 aa  128  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
894 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 
986 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 
1051 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 
1090 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 
924 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 
978 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 
957 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
951 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
951 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
951 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  31.12 
 
 
908 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 
878 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  28.2 
 
 
942 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 
878 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 
878 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 
878 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 
908 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
958 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27.89 
 
 
941 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 
940 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 
927 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
875 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
939 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
881 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
939 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
906 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 
918 aa  107  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 
990 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
926 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 
880 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
1007 aa  105  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 
958 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
957 aa  104  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
900 aa  104  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  30.31 
 
 
908 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 
908 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 
875 aa  104  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
882 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 
1074 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 
934 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
993 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.79 
 
 
940 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 
1077 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
976 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 
943 aa  102  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
914 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
994 aa  102  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  29.12 
 
 
908 aa  101  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 
921 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 
922 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
912 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
988 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
919 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 
1003 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
988 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 
1036 aa  99  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 
1017 aa  99  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 
998 aa  97.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 
982 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 
982 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>