More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0176 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 924 aa  1891    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  40.9 
 
 		 933 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 1090 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 1051 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 962 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 957 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 931 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 957 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1003 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1077 aa  327  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 897 aa  241  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 888 aa  234  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 920 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 932 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 892 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 894 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 916 aa  208  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 897 aa  208  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 927 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 897 aa  195  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 946 aa  195  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 888 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 938 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 972 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 917 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 1004 aa  127  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 991 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 1001 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 922 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 962 aa  119  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 919 aa  118  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 917 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 901 aa  111  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 944 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 943 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 941 aa  104  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.75 
 
 		 972 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 942 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  24.09 
 
 		 929 aa  98.2  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 936 aa  97.8  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 961 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 945 aa  91.3  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 943 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 1082 aa  88.2  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 958 aa  83.2  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 935 aa  82.8  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  40.54 
 
 		 1089 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  42.37 
 
 		 1066 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 952 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 836 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.78 
 
 		 838 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  45.83 
 
 		 1087 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 935 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1079 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 933 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 897 aa  75.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 888 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1062 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 1028 aa  74.3  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 795 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1104 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 779 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1106 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1147 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  40.34 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1074 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 958 aa  71.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1047 aa  71.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1076 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 759 aa  71.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 853 aa  70.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1033 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1148 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1070 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1076 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.21 
 
 		 992 aa  68.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  37.19 
 
 		 1100 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1006 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 855 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1020 aa  68.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 880 aa  68.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 775 aa  67.8  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  34.64 
 
 		 1095 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 1175 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 791 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1040 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1102 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1038 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 994 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1058 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 998 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 992 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1052 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  37.24 
 
 		 1006 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>